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生物信息学以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它通过综合应用数学、统计学、计算机科学以及生物学的技术来分析大量而复杂的生物学数据。其在蛋白质组学的研究中有两个重要应用:一是通过已知测序的全基因组序列预测对应全蛋白质序列、建库;二是通过和已知蛋白数据库比较,解析由LC-MS/MS系统采集的海量谱图数字。除此之外,基于LC-MS/MS的研究方法,需要开发大量分析数据的软件,如基于数据库检索的蛋白质组鉴定,各种标记、无标记蛋白质组定量的数据分析,都需要可靠的算法和好用的软件来实现。生物信息学在蛋白质组学研究中正发挥着越来越重要的作用。

GO分析与GO富集分析

背景介绍: 基因本体论(Gene Ontology Consortium)提供了规定的词汇来描述基因产物的术语(terms),即注释(annotation)...

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KEGG 通路分析

背景介绍:生物世界纷乱复杂,但是许多基本的生物途径PATHWAY是通用的。在漫长的进化中,为了适应各种环境和自身发展的需求,每个物种都发展了属于自己的独特的版本...

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TCGA与GEO数据库再挖掘分析

TCGA、NCBI GEO、NCBI SRA、EBI ArrayExpress等是含有高通量数据的数据库,其中TCGA是一个非常权威的、数据量巨大的、组学丰...

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蛋白互作网络分析

根据所提供的蛋白质或基因信息以蛋白质相互作用数据库为基础,构建蛋白质相互作用网络。对于构建的网络,采用网络计算的方法计算重要的节点。目前,常用用于构建蛋白质相互...

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